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La flora de la reserva es muy variado, con todo, desde poducarpus a la caoba, palmas, bromelias y una abrumadora variedad de orquídeas. La fauna es muy variada, incluyendo especies como: pumas, monos aulladores, monos saki, el mono tití, monos nocturnos, ardillas, pecaríes de collar y, ocelotes, gatos tigrillo, perezosos, osos hormigueros, armadillos, coatíes, agutis pacas, nutrias, caimanes y, ocasionalmente, jaguares y tapires. Las aves son aún más numerosos y representan especies como los guacamayos militares, pericos, tucanes, pavas, pavas de monte, colibríes, saltarines, hormigueros, fruteros, perdices y oropendulas. Los habitantes locales pueden nombre y saber más de 220 especies de aves que están presentes en el entorno inmediato de la comunidad.

Además, la reserva está conectado a otro 250,000 acres de tierras forestales de propiedad comunal y se extiende tranquilo todo el camino a Perú y Brasil. La reserva se encuentra dentro de uno de los puntos mega diversidad del mundo. Países megadiversos son aquellos que debido a su posición geográfica, las características ambientales, y la historia tiene una enorme cantidad de diferentes tipos de organismos. Ecuador pertenece a la élite selecta de los 17 países megadiversos del mundo, de los cuales se ubica como número ocho. Estos 17 países, que también incluyen a Brasil, Colombia e Indonesia, anfitrión entre el 60 y el 70 por ciento de toda la biodiversidad de la Tierra. Ecuador es especial porque es el país más pequeño de la clase de mega diversidad.

Una hectárea o 2,5 hectáreas de selva tropical en el Ecuador y Arutam puede contener más de 750 tipos de árboles y 1.500 especies de plantas superiores. En total, en Ecuador, hay una estimación de unas 25.000 especies de plantas solo (en comparación con 17.000 especies en el conjunto de América del Norte) y hay 1.600 aves que se encuentran en el país que es más del doble de la especie en Europa.

Hay 369 especies conocidas de mamíferos, 350 especies de reptiles - que contiene más de 200 especies de serpientes. Existen alrededor de 400 anfibios en el país, que es la mayoría de las especies de ranas en el mundo, así como un estimado de 800 especies de peces en las aguas del Amazonas. El número de invertebrados, especialmente los insectos es desconocida, pero que son los más numerosos de todas las criaturas vivas, que van en los cientos de miles de personas